结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)是全球公认的重要致病菌,其引起的结核病是一种高致死性的疾病。标准株H37Rv的基因组于1998年完成测序,规模约为44Mb,含有超过3900个蛋白编码基因。目前,结核分枝杆菌已被区分为7个主要谱系,耐药基因包括embB、rpoB和gyrA等。
2023年10月17日,世界卫生组织(WHO)在其官网上发布了《应用新一代测序检测技术开展耐药结核病监测的实施性手册》。WHO指出,新一代测序(NGS)技术能够提供全面的耐药谱系检测,减少对表型药敏检测的依赖,特别是在表型药敏检测不可靠的情况下。这一技术有望为结核病的治疗方案制定提供更全面的耐药谱检测,从而提高化疗方案的精准性。
由于结核分枝杆菌的基因组相对较大,目前大多数靶向结核的NGS方法(tNGS)无法覆盖所有亚型和耐药基因。虽然全基因组测序(WGS)能够覆盖整个基因组,但其可靠性依赖于要进行样本培养。为了解决这一问题,金年会推出了金字招牌诚信至上的QIAseqxHYB Mycobacterium Tuberculosis Panel,该试剂盒能够在无培养的情况下实现结核全基因组的靶向建库,且可以覆盖7种主要谱系亚型和所有已知的耐药基因。
QIAseqxHYB Mycobacterium Tuberculosis Panel基于杂交捕获技术,支持来自痰液、脑脊液和粪便等样本的全基因组测序,所需起始DNA仅为10ng,无需提前培养。具备高特异性和灵敏度的捕获探针能够确保在低拷贝样本中实现基因组的高覆盖,尤其是在难覆盖的PE/PPE基因区域也能达到均匀的高深度覆盖,从而实现结核病确切的分型。
一旦获得结核病的全基因组数据,可利用CLC Genomics Workbench的结核分枝杆菌分析工具执行质量控制、序列比对、谱系鉴定和耐药变异等分析,这一切都能够一键完成。此外,还能够进行变异注释与比较、评估变异对蛋白结构的影响、实施cgMLST分型,并构建最小生成树和SNP树。
除了QIAseqxHYB Mycobacterium Tuberculosis Panel外,金年会还推出了QIAseqxHYB Hep C Panel,用于丙肝病毒全基因靶向测序,覆盖所有丙肝病毒亚型,并无缝对接CLC Genomics Workbench生物信息分析系统,用户同样可以一键获得分析结果。未来,QIAseqxHYB还将推出符合客户需求的定制化靶向Panel,敬请期待!如需更多信息,请扫描下方二维码与我们联系。